微波殺菌設備操作過程中，除了注意不能采用金屬容器和鍍鋁或鋁復合袋，還存在殺菌過程中密封好的袋子破袋問題。目前采用微波殺菌可以在包裝前進行，也可以在包裝好以后進行。包裝好的食品在進行微波加熱殺菌時，由于袋內壓力過高會脹破包裝袋，因此整個微波加熱殺菌過程應在壓力下進行，或將包裝置于加壓的玻璃容器中進行處理。

　　微波殺菌是當代一類嶄新的技術，它加熱時間短、升溫速度快、殺菌均勻，既有利于保持食品功能成分的生活理性，又有利于保持原料的色、香、味及營養成分。微波殺菌技術能夠很大程度的保持食品物料的營養成分，殺菌效果顯著，可以使食品不添加防腐劑而延長保存期。微波殺菌技術的優勢逐漸受到人們的重視，應用也遍及糧油制品、調味品、禽肉制品、豆制品和奶制品等方面。

　　微波加熱技術應用范圍極廣闊，微波加熱技術在食品加工中應用僅是其中的一小部分。可以這樣說，人們在認識微波加熱特點的過程中，同時正在與現有技術相結合去開發出越來越多的新裝置和儀器。例如，微波爐和冰箱的組合冰箱;微波水壺和微波卷發器，微波加熱和洗衣機組合的微波烘干、洗衣機;微波熱水器，低溫水分測量儀等。

　　微波加熱技術的發展與人們的認識和掌握，以及市場需求是密切相關的，其中完善微波殺菌設備和加工工藝尤為關鍵。

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